比如，实行提名制。目前国家科技奖实行的是科技人员申报、政府部门推荐制，不仅行政色彩浓，而且花费了科技人员的大量时间和精力。为提高评奖的学术性，《方案》提出，参照国际惯例实行提名制，把过去的主动自荐改为背靠背的他荐，以引导科技人员潜心研究、专注学术，遏制浮躁等不良风气。
再比如，定标定额、瘦身提质。“定标”就是分类制定各奖种及其相应等级的评价标准，确保获奖项目质量；对自然科学奖、技术发明奖、科技进步奖，由过去的一、二等奖混合评审改为一、二等奖分别评审，落选的一等奖项目不能参评二等奖。“定额”就是改变奖励指标数与受理数量按既定比例挂钩的做法，分别限定三大奖的授奖数量。《方案》还提出，大幅减少奖励数量，三大奖总数由不超过400项减少到不超过300项。
《方案》顺应了科技界的改革愿望，对于进一步增强国家科技奖的学术性、突出导向性、提升权威性、提高公信力、彰显荣誉性，将发挥巨大的推动作用。
由于《方案》主要是明确了深化科技奖励制度改革的方向，一些措施在具体实施过程中还需要进一步研究细化。比如，在实行提名制方面，提名人的标准是什么，是不是只有院士才有提名资格？学术组织提名如何操作，谁来具体承担责任？提名个人和机构怎样才能履行好推荐、答辩、异议答复等责任，并对相关材料的真实性负责？
再比如，《方案》提出，三大奖总数由不超过400项减少到不超过300项。这是一项重大进步，但也有专家指出，在实际操作过程中，还应该严格控制奖励数量。中外有影响的科技奖项表明，数量越少越容易保证质量，位于金字塔尖上的成果往往是特别突出、公认度高的，评选也容易，越往下质量水平越难保证。与此同时，数量过多往往导致太多人报奖，既浪费了科技人员的精力，还浓厚了名利、浮躁了学风、淡薄了对科学真理的追求。因此，应本着宁缺毋滥的精神，严格控制三大奖的数量。
国家科技奖代表的是中国科技创新的最高水平，希望主管部门和执行单位切实把《方案》落实到位，做到评奖结果让科技界充分认可，维护好国家科技奖的公信力。